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單細(xì)胞測(cè)序及其在病毒學(xué)上的應(yīng)用
主要解決的問題主要有兩個(gè):一是異質(zhì)性(heterogeneity),比如a)鑒定某些因?yàn)楹浚ū壤┹^低而在常規(guī)RNA測(cè)序檢測(cè)時(shí)被“掩蓋”的細(xì)胞亞群;b) 檢測(cè)細(xì)胞群體中不同的個(gè)體細(xì)胞:比如
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10X Genomics 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq)是在單個(gè)細(xì)胞水平對(duì)mRNA進(jìn)行高通量測(cè)序的一項(xiàng)新技術(shù),原理是將分離的單個(gè)細(xì)胞中微量的mRNA通過高效擴(kuò)增后再進(jìn)行高通量測(cè)序。
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)原理
單細(xì)胞測(cè)序主要涉及單細(xì)胞基因組測(cè)序和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序兩個(gè)方面,分別針對(duì)單細(xì)胞DNA及RNA進(jìn)行序列分析和比較。單細(xì)胞測(cè)序一直是科學(xué)家關(guān)注的一個(gè)熱點(diǎn)。
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實(shí)體組織制備溫和組織處理器
流式細(xì)胞術(shù)作為一種可在單細(xì)胞水平上對(duì)大量細(xì)胞進(jìn)行快速、準(zhǔn)確、多參數(shù)定量分析和分選的高技術(shù);進(jìn)行流式細(xì)胞術(shù)分析的前提是樣品為單細(xì)胞懸液,根據(jù)不同實(shí)體組織成分的特點(diǎn)可選擇不同的分散細(xì)胞的方法,以期達(dá)到單細(xì)胞產(chǎn)量高、細(xì)胞損傷小的目的。
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溫和組織處理器的制備方法有那幾點(diǎn)
實(shí)體組織 溫和組織處理器 的制備方法有那幾點(diǎn) (1)機(jī)械法 1)用剪刀剪碎或者用鋒利的解剖刀剁碎組織; 2)將剪碎的組織加入勻漿器中勻漿; 3)用吸管或注射器抽吸細(xì)胞懸液,以分散細(xì)胞;
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大規(guī)模單細(xì)胞測(cè)序時(shí)代開啟
近期,Nature Methods發(fā)表了數(shù)篇關(guān)于大規(guī)模單細(xì)胞測(cè)序相關(guān)文章,包括文庫(kù)制備、測(cè)序方法、分析方法等,這里介紹其中的幾篇。
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高通量的單細(xì)胞RNA測(cè)序新方法:sNuc-Seq
去年,Broad研究所的研究人員在《Science》上發(fā)表了一種稱為sNuc-Seq的單核RNA測(cè)序方法。
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的方法原理及應(yīng)用
常規(guī)的轉(zhuǎn)錄組分析方法通常需要103個(gè)細(xì)胞,所以無法揭示單個(gè)細(xì)胞之間基因表達(dá)的異質(zhì)性,也難以對(duì)諸如早期胚胎及異質(zhì)性的組織干細(xì)胞和腫瘤干細(xì)胞等少量細(xì)胞進(jìn)行分析,而單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)為此提供了有效的研究工具。
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