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　　2016年，10x Genomics公司推出ChromiumTM系統(tǒng)，這是一套分子條形碼和分析系統(tǒng)，由儀器、試劑盒和信息學(xué)軟件組成，能全面對接Illumina測序儀。

　　鱘魚被認(rèn)為是活化石，具有很高的進化，經(jīng)濟和保護價值。由染色體重復(fù)引起的鱘魚的倍性可能導(dǎo)致涉及倍性和生理過程的新微小RNA(miRNA)的出現(xiàn)。

　　在本研究中，來自華南瀕危動物研究所的研究人員通過RNA-seq高通量測序結(jié)合微陣列和實時PCR的表達分析進行了第一次鱘魚miRNA分析，旨在發(fā)現(xiàn)鱘魚特異性miRNA，確認(rèn)miRNA的表達模式，并說明miRNAs靶標(biāo)對鱘魚生物過程的潛在作用。共鑒定出103種miRNA，包括58種具有強烈檢測信號的miRNA(信號> 500和P≤0.01)，通過微陣列檢測。實時PCR測定支持通過微陣列獲得的表達模式。此外，所有五種組織中21種miRNA的共表達和16種miRNA的組織特異性表達暗示了它們在鱘魚生理過程中的關(guān)鍵和特殊功能。靶基因預(yù)測，特別是58個miRNA調(diào)節(jié)的富集功能基因組(369個GO術(shù)語)和途徑(37個KEGG)(P<0.05)，說明了miRNA和推定的mRNA的相互作用，以及這些生物過程中涉及的潛在機制。這些鱘魚miRNA的新發(fā)現(xiàn)擴展了該物種的轉(zhuǎn)錄組信息公共數(shù)據(jù)庫，有助于我們對鱘魚生物學(xué)的理解，并提供可用于鱘魚繁殖的寶貴數(shù)據(jù)。

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