2016年，10x Genomics公司推出ChromiumTM系統(tǒng)，這是一套分子條形碼和分析系統(tǒng)，由儀器、試劑盒和信息學軟件組成，能夠?qū)覫llumina測序儀。
鱘魚被認為是活化石，具有很高的進化，經(jīng)濟和保護價值。由染色體重復引起的鱘魚的倍性可能導致涉及倍性和生理過程的新微小RNA(miRNA)的出現(xiàn)。
在本研究中，來自華南瀕危動物研究所的研究人員通過RNA-seq高通量測序結(jié)合微陣列和實時PCR的表達分析進行了一次鱘魚miRNA分析，旨在發(fā)現(xiàn)鱘魚特異性miRNA，確認miRNA的表達模式，并說明miRNAs靶標對鱘魚生物過程的潛在作用。共鑒定出103種miRNA，包括58種具有強烈檢測信號的miRNA(信號> 500和P≤0.01)，通過微陣列檢測。實時PCR測定支持通過微陣列獲得的表達模式。此外，所有五種組織中21種miRNA的共表達和16種miRNA的組織特異性表達暗示了它們在鱘魚生理過程中的關(guān)鍵和特殊功能。靶基因預測，特別是58個miRNA調(diào)節(jié)的富集功能基因組(369個GO術(shù)語)和途徑(37個KEGG)(P<0.05)，說明了mirna和推定的mrna的相互作用，以及這些生物過程中涉及的潛在機制。這些鱘魚mirna的新發(fā)現(xiàn)擴展了該物種的轉(zhuǎn)錄組信息公共數(shù)據(jù)庫，有助于我們對鱘魚生物學的理解，并提供可用于鱘魚繁殖的寶貴數(shù)據(jù)。
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